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New Phytologist(IF=8.1)|DAP-seq助力解析擬南芥雄性育性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

更新時(shí)間:2025-09-24   點(diǎn)擊次數(shù):306次

202576日,浙江大學(xué)徐娟教授團(tuán)隊(duì)在New Phytologist期刊發(fā)表了一篇題為“A DELLA-ANAC106 reciprocal negative feedback circuit modulates gibberellin homeostasis to regulate male fertility in Arabidopsis"研究論文。該研究借助DAP-seq技術(shù)揭示了擬南芥中DELLA-ANAC106雙向負(fù)反饋回路調(diào)控赤霉素(GA)穩(wěn)態(tài)以維持雄性育性的分子機(jī)制,為植物生殖過(guò)程中植物激素調(diào)控提供新范式,也為作物遺傳改良提供了重要的理論基礎(chǔ)和潛在靶點(diǎn)。

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文章主要內(nèi)容

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研究背景

花粉形成是開(kāi)花植物繁殖的關(guān)鍵,其發(fā)育與花藥絨氈層(最內(nèi)層細(xì)胞)的精準(zhǔn)調(diào)控緊密相關(guān)。絨氈層需通過(guò)程序性細(xì)胞死亡(PCD)為花粉提供營(yíng)養(yǎng),提前或延遲降解均會(huì)致花粉敗育。赤霉素(GA)的劑量與合成位置對(duì)花粉發(fā)育至關(guān)重要:GA缺陷突變體(如ga1-3)花粉發(fā)育停滯,過(guò)量GA也會(huì)引發(fā)雄性不育,足見(jiàn)GA穩(wěn)態(tài)是育性核心調(diào)控因素。

GA通過(guò)結(jié)合受體GID1降解DELLA抑制蛋白激活信號(hào),擬南芥中DELLA蛋白(如RGA、GAI)是花藥發(fā)育關(guān)鍵抑制因子,其突變會(huì)致不育。雖GA代謝通路已明晰,但花粉發(fā)育中GA水平調(diào)控的分子機(jī)制仍不明,且NAC轉(zhuǎn)錄因子家族在該過(guò)程中的作用未知。

研究結(jié)果

研究發(fā)現(xiàn)AT3G12910MPK3/MPK6激活上調(diào),經(jīng)鑒定為新NAC轉(zhuǎn)錄因子ANAC106。為研究其功能,作者構(gòu)建了ANAC106過(guò)表達(dá)株系(OE),發(fā)現(xiàn)高表達(dá)株系嚴(yán)重矮化無(wú)花序,中等表達(dá)株系表現(xiàn)為雄性不育,無(wú)法形成可育角果。亞歷山大染色顯示,OE株系花藥無(wú)可育花粉;野生型花粉授粉可使OE株系結(jié)籽,表明其雌性器官功能正常。GUS染色顯示,ANAC106在幼嫩花藥中高表達(dá),表明其在雄性生殖過(guò)程中的特異性作用。作者進(jìn)一步構(gòu)建了ANAC106-EAR顯性負(fù)性株系,發(fā)現(xiàn)EAR株系與OE株系表型相似,均表現(xiàn)為雄性不育,花藥成熟花粉極少;且自身啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)的該株系也不育。綜上表明,ANAC106過(guò)表達(dá)與抑制的正常功能與均會(huì)導(dǎo)致擬南芥雄性不育。

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1. 過(guò)量表達(dá)ANAC106導(dǎo)致擬南芥雄性嚴(yán)重不育

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2. 顯性負(fù)調(diào)控ANAC106同樣會(huì)導(dǎo)致擬南芥雄性不育

為探究OEEAR株系雄性不育機(jī)制,作者觀察不同發(fā)育階段花藥半薄切片,發(fā)現(xiàn)與野生型相比,EAR株系花藥第9-10階段絨氈層降解延遲,第9階段絨氈層肥大、小孢子降解,第12階段花粉敗育;OE花藥絨氈層發(fā)育不良且降解提前,第9階段無(wú)完整絨氈層,第10階段降解,第11階段花粉敗育。相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平檢測(cè)顯示,DYT1、MYB35TDF1)等絨氈層發(fā)育基因,在OEEAR花序中表達(dá)均較低;絨氈層降解相關(guān)的CEP1PASPA3基因在OE中表達(dá)顯著高于野生型,EARCEP1表達(dá)降低。綜上表明,ANAC106是花藥絨氈層細(xì)胞程序性降解的重要正調(diào)控因子。

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3. 過(guò)表達(dá)和顯性負(fù)抑制對(duì)ANAC106在擬南芥花粉中的發(fā)育具有相反的影響

為鑒定ANAC106在調(diào)控絨氈層降解中的直接靶基因,通過(guò)DAP-seq鑒定出10665個(gè)潛在結(jié)合位點(diǎn),核心序列為“MRRYGSCGTNDHNDHNMCGBHRH",該CGT(7n)MCG基序與已知NAC成員保守,且發(fā)現(xiàn)ANAC106結(jié)合GA3ox2啟動(dòng)子與GA3ox41外顯子。GO富集分析顯示赤霉素代謝基因富集。同時(shí)作者構(gòu)建了DEX誘導(dǎo)型株系,發(fā)現(xiàn)DEX處理致花發(fā)育缺陷及雄性不育。RNA-seqGO富集分析顯示,均富集赤霉素生物合成過(guò)程調(diào)控,且僅赤霉素處理上調(diào)ANAC106表達(dá)。EMSAqPCR和雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí)了ANAC106結(jié)合并激活GA3ox2/4表達(dá)。此外,還發(fā)現(xiàn)ANAC106還靶向GA2ox1。綜上表明,ANAC106可能通過(guò)靶向赤霉素合成與失活基因調(diào)控活性赤霉素平衡。

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4. ANAC106直接調(diào)控?cái)M南芥赤霉烯(GA)代謝相關(guān)基因表達(dá)

為驗(yàn)證ANAC106對(duì)活性赤霉素(GA)水平的調(diào)控作用,作者通過(guò)UHPLC-MS/MS檢測(cè)相關(guān)轉(zhuǎn)基因株系,結(jié)果顯示經(jīng)DEX處理的OE株系活性GA含量顯著升高,EAR株系GA水平略低或與野生型持平,表明ANAC106雙向調(diào)控GA合成與失活。Westernblot結(jié)果顯示,OE株系中DELLA蛋白(RGA、GAI)豐度顯著降低,EAR株系中DELLA蛋白積累;DEX誘導(dǎo)ANAC106表達(dá)可促進(jìn)RGA/GAI降解,且蛋白酶體抑制劑MG132能抑制該過(guò)程,表明ANAC106通過(guò)GA依賴(lài)的泛素-蛋白酶體途徑降解DELLA。作者進(jìn)一步構(gòu)建MYC-GAI轉(zhuǎn)基因株系并與GVG:ANAC106雜交,發(fā)現(xiàn)DEX處理的雙轉(zhuǎn)基因株系MYC-GAI水平降約50%,且降解同樣依賴(lài)泛素-蛋白酶體途徑。此外,OE株系不育表型與rga/gai雙突變體相似,OE花序中RGA豐度降低、EAR株系中升高,進(jìn)一步表明DELLA蛋白參與ANAC106調(diào)控的花粉發(fā)育。

New Phytologist(IF=8.1)|DAP-seq助力解析擬南芥雄性育性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)

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5. ANAC106正向調(diào)控?cái)M南芥中生物活性赤霉素(GAs)的水平,并負(fù)向影響DELLA蛋白的豐度

為進(jìn)一步探究ANAC106DELLA蛋白的關(guān)系,作者構(gòu)建了兩個(gè)RGA-eYFP轉(zhuǎn)基因株系(分別由絨氈層特異性LTP12啟動(dòng)子和花粉特異性LAT52啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)),并與ANAC106-OE株系雜交獲得雙轉(zhuǎn)基因株系。結(jié)果顯示,兩種雙轉(zhuǎn)基因株系的不育表型均顯著恢復(fù):可產(chǎn)生可育角果。亞歷山大染色顯示花粉活力大幅提升,半薄切片顯示絨氈層提前降解缺陷得到改善。以上結(jié)果表明,在ANAC106調(diào)控的花粉發(fā)育基因網(wǎng)絡(luò)中,DELLA蛋白在下游發(fā)揮重要作用。

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6. ANAC106通過(guò)赤霉素(GA-DELLA通路調(diào)控?cái)M南芥雄性生殖力

酵母雙雜交(Y2H)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,擬南芥5DELLA蛋白中,除RGL1外,其余4種均能與ANAC106相互作用。免疫共沉淀(Co-IP)結(jié)果進(jìn)一步證實(shí),RGAGAI在體內(nèi)可與ANAC106蛋白相互作用。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),RGAGAI均與ANAC106N端區(qū)域(含DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域)相互作用,而不與C端相互作用。隨后,作者在擬南芥葉肉原生質(zhì)體中進(jìn)行了瞬時(shí)表達(dá)實(shí)驗(yàn)。結(jié)果顯示,ANAC106可激活GA3ox2GA3ox4的熒光素酶活性,而RGAGAI可劑量依賴(lài)地抑制該活性。綜上表明,DELLA蛋白與ANAC106的相互作用以劑量依賴(lài)方式抑制ANAC106的轉(zhuǎn)錄活性。

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7. DELLA蛋白抑制ANAC106的轉(zhuǎn)錄活性

本研究揭示擬南芥中DELLA-ANAC106雙向負(fù)反饋回路調(diào)控赤霉素(GA)穩(wěn)態(tài)、維持雄性育性的機(jī)制:新發(fā)現(xiàn)的NAC轉(zhuǎn)錄因子ANAC106可激活GA合成基因(GA3ox2、GA3ox4)以提升活性GA水平,促進(jìn)DELLA蛋白降解;而DELLA蛋白(如RGAGAI)則以劑量依賴(lài)方式與ANAC106互作,抑制其轉(zhuǎn)錄活性,避免GA過(guò)量。ANAC106過(guò)表達(dá)(功能獲得)致絨氈層提前降解,顯性負(fù)抑制(功能缺失)致其延遲降解,二者均引發(fā)雄性不育。該回路通過(guò)自我校正實(shí)現(xiàn)花藥GA時(shí)空精準(zhǔn)調(diào)控,為植物生殖激素調(diào)控提供新范式。

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8. DELLA-ANAC106反饋回路調(diào)控?cái)M南芥花粉發(fā)育的功能模型




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